Il medico e insegnante Sebastián Roldán y Maldonado, per volontà, donò nel 1735 la sua ricchezza di 26mila pesos per le missioni dei gesuiti nel mondo della Nuova Spagna.
Sua sorella, la signora Ángela Roldán, vedova di H. (O) rdeñana, anni dopo, nel 1743, decise di aggiungere 50mila pesos all'eredità del fratello per lo stesso scopo. I superiori decisero quindi di acquisire a Puebla il terreno adiacente alla Plaza de Guadalupe per costruire la chiesa e la scuola di San Francisco Javier, ultima opera importante della Compagnia di Gesù in quella città e in Messico prima della loro espulsione.
Tra il 1 ° e il 13 dicembre 1751, si tenne l'apertura della chiesa e della scuola, come quella di San Gregorio de México, impartire la dottrina cristiana e le prime lettere tra i nativi, svolgere il lavoro missionario nei quartieri di Angelópolis e in la Sierra de Puebla, nonché per formare i gesuiti nelle lingue naturali. Nei suoi primi anni contava più di 200 studenti.
Lì lavorò come operaio indiano dal 1761, secondo i documenti, la più famosa delle personalità del suo tempo: Francisco Javier Clavijero (1731-1787), gesuita importante e rispettabile nella storia delle idee, precursore della nostra dipendenza, iniziatore ed esaltatore della nostra forte eredità culturale indigena, riformatrice della moderna filosofia del Messico e dell'insegnamento della scienza, per la sua "comprensione della patria come una realtà diversa dalla Spagna" e per la sua permanente e sensibile lezione di amore per ciò che è nostro.
Clavijero era già stato a Puebla e, anni fa, a San Jerónimo, San Ignacio, EI Espíritu Santo e San Ildefonso, determinanti della sua formazione umanistica. Ritornò a San Javier dopo aver scoperto la meravigliosa eredità che Carlos de Sigüenza y Góngora aveva lasciato al Colegio de San Pablo de la Vieja México-Tenochtitlan, sicuramente attratto dalla grandezza indigena, dalle radici culturali del Messico. Si presume che questo gesuita abbia imparato il nahuatl a San Javier, il che gli avrebbe permesso di scrivere la sua fondamentale storia antica del Messico in esilio.
Indubbiamente, la sua permanenza a Puebla contribuì a forgiare questa straordinaria personalità, che passò da Angelópolis a Valladolid (Morelia), dove in seguito i suoi insegnamenti influenzarono la formazione di figure nazionali come Miguel Hidalgo y Costilla.
La chiesa di San Javier, costruita nel XVIII secolo, era uno degli edifici più belli dell'ordine ignaziano a Puebla, la sua decorazione è di tutti i gusti, la sua cupola arrogante ha un'unica torre, le sue belle immagini della facciata di tre corpi di un dorico bizzarro, dice Marco Díaz. I suoi portici e il patio furono trasformati anarchicamente nel 1949, lasciando solo un ingresso laterale di forme interessanti.
Nell'abside vi era una pala d'altare dorata di pregevole e squisita fattura, al centro della quale era posta, sotto un bel padiglione delle stesse dimensioni, una bella effige di San Francesco Saverio. Secondo il dottor Efraín Castro, gli autori di questa pala d'altare sono gli stessi che hanno realizzato quella di Tepozotlán: Miguel Cabrera e Higinio de Chávez.
Il tempio fu abbandonato con l'espulsione dei Gesuiti nel 1767; 28 anni dopo, nel 1795, si parla del suo grande deterioramento e l'anno successivo Antonio de Santa María Inchaurregui commenta la sua riparazione. La destinazione finale delle sue ricchezze artistiche è attualmente sconosciuta, come le pale d'altare con le figure dei santi José e Ignacio e notevoli pezzi guatemaltechi. Sulla copertina di San Javier, durante la pulizia delle sue pietre, gli impatti delle schegge ricevute nel sito di Puebla nel 1863 emersero come testimoni silenziosi.
In virtù di una legge emanata dal Congresso dell'Unione, il 13 gennaio 1834, San Javier divenne proprietà del governo dello Stato di Puebla, e fu allora che il nuovo penitenziario statale fu costruito accanto al tempio e al collegio in conformità con con i progetti del grande architetto e restauratore di Puebla José Manzo (1787-1860), alla maniera della prigione di Cincinnati. Questo progetto, molto avanzato a suo tempo, prevedeva laboratori per la riabilitazione dei detenuti che li tenevano attivi e fornivano mezzi di sostegno alle loro famiglie.
Il merito iniziale di questo lavoro corrisponde al generale Felipe Codallos, governatore dello stato dal 1837 al 1841, che pose la prima pietra l'11 dicembre 1840. I progressi della costruzione furono notevoli fino al 1847, quando furono interrotti e gravemente colpiti dalla ragione dell'intervento americano. Nel 1849, con il governatore Juan Mújica y Osorio, i lavori furono ripresi, ma un nuovo intervento, ora quello francese, sospese nuovamente la costruzione.
Dopo la sublime vittoria del 5 maggio 1862 e la sua occupazione come caserma, il Poblano Joaquín Colombres convertì il Penitenziario in Forte Iturbide per la difesa della città, diventando il sito eroico del 1863. San Javier, per il suo In parte, dal 18 al 29 marzo di quell'anno fu un baluardo molto importante dove le truppe messicane scrissero una delle loro migliori poesie, anche se l'edificio fu quasi totalmente distrutto dai bombardamenti.
Un anno dopo, nel 1864, un forte terremoto danneggiò notevolmente il complesso carcerario e l'edificio San Javier, da cui cadde la sua unica torre.
Il 13 dicembre 1879, un gruppo di pueblani si assunse il compito di continuare e portare a termine la grande opera, formando un comitato di ricostruzione che il generale Juan Crisóstomo Bonilla (governatore dal 1878 al 1880) sponsorizzò con decreto del Congresso di Stato. I lavori iniziarono il 5 febbraio 1880, sotto la direzione dell'architetto di Puebla Eduardo Tamariz e Juan Calva y Zamudio, che rispettarono le linee guida originali di José Manzo.
Con i successivi governatori dell'entità (i generali Juan N. Méndez che governò nel 1880 e Rosendo Márquez che lo fece tra il 1881 e il 1892) il lavoro senza fine fu concluso. La ricostruzione era quasi completa: appartamenti maschili e femminili, volte, scale, uffici, 36 padiglioni e mezzo migliaio di celle.
Il 1 aprile 1891, la pena di morte fu abolita nello stato -primo nel paese-, fu creato il Consiglio per la protezione dei prigionieri e furono fatte varie riforme al codice penale dell'ente, e il giorno successivo Porfirio Díaz, presidente della La Repubblica mette in servizio il Penitenziario.
Per quanto riguarda i costi della sua costruzione, vale la pena ricordare i seguenti dati: nel 1840 fu stabilito un contributo speciale del 2,5% sulla vendita di liquori, e nel 1848 alle pulquerías fu fissata una quota di 2 reales se manarios, " tasse ”che non erano mai sufficienti per la grande opera. Dal 1847 al 1863 furono investiti 119 540,42 pesos e dal 1880 al 1891 furono spesi 1882 085,14.
I comuni coprivano mensilmente il mantenimento dei detenuti provenienti dalla loro regione. La spesa annua del Penitenziario nei primi anni è stata di oltre 40mila pesos. Nel 1903, i dottori Gregorio Vergara e Francisco Martínez Baca istituirono presso l'istituto un laboratorio antropometrico e criminalistico, nonché un museo con più di 60 teschi di detenuti morti nella prigione, attualmente sotto la custodia dell'INAH.
L'edificio San Javier aveva vari usi: caserma, magazzino, ospedale militare, ospedale per epidemie, caserma dei vigili del fuoco, reparto elettrico comunale e sala da pranzo del penitenziario, per il quale fu gradualmente distrutto. Nel 1948 fu installata una scuola statale nel cortile e nei portici di San Javier, che danneggiò gravemente il complesso architettonico, e nel 1973 e negli ultimi anni le sue volte furono gravemente danneggiate.
Il Penitenziario di Puebla è stato operativo fino al 1984, anno in cui il governatore dello Stato, Guillermo Jiménez Morales, ha tenuto una consultazione popolare per lasciare la decisione sull'uso e la destinazione di questi edifici storici nelle mani dei cittadini di Puebla, in uno dei quali ha brillato il talento di Francisco Javier Clavijero, le nostre lingue indigene furono diffuse e fu svolto un importante lavoro educativo, oltre al fatto che in entrambi l'integrità nazionale fu bizzarramente difesa, almeno in due occasioni. All'unanimità, la gente di Puebla ha chiesto all'Esecutivo di rimodellare il Penitenziario e salvare San Javier per dedicarli ad attività culturali e come ricche testimonianze, essenziali per mantenere viva la memoria storica di Puebla.
